PELABUHAN SEMAYANG
terletak di Kecamatan Prapatan, yang bisa dijangkau dengan mikrolet No. 6 dari Terminal Damai. Pelabuhan ini adalah pelabuhan yang paling sibuk di Balikpapan karena merupakan pelabuhan barang maupun penumpang ke kota-kota bagian timur Indonesia, seperti Jakarta atau Surabaya.
PT. Pelni, perusahaan pelayaran nasional, memiliki layanan ke/dari kota lain di Indonesia, seperti Nabire, Tarakan, Nunukan, Parepare, Surabaya, Jayapura, Makassar, Maumere, Kupang, Surabaya, dan Jakarta. Untuk jadwal kapal antar provinsi silakan kunjungi website Pelni: www.pelni.co.id atau dapat menghubungi nomor call center mereka di 021 79180606 (beroperasi setiap hari dari pk. 7:00 hingga 20:00).
callcenter pelabuhan: 424171.